五都争劳动检查权，非五都的云林县政府面对六轻工安不断，颇感无奈。劳委会表示，虽然云林县非劳委会授权劳动检查机构，但依「职业安全卫生法」及地方自治权限，地方政府原本就可对辖区事业单位劳动检查，只是云林县没有专责劳动检查人力，劳委会中区检查所投注大批人力将六轻列重点检查对象。
劳委会现有北、中、南三区劳动检查所，总计179位劳动检查员。另外获劳委会授权劳检机构另有北、高两市，及三个科学园区检查所、加工出口区检查所。
劳委会表示，除该会授权之外，其它县市并非不能进行劳动检查。例如职业安全卫生法第27条规定，主管机关及检查机关可以对各事业单位工作场所实施检查；另根据地方制度法，县市政府也可本于地方自治，设立机构劳动检查。但是过去因为地方政府没有专业人力及经费编制，因此除北、高之外，都由劳委会所属检查所负责安全卫生检查。
地方执行 难确保劳检质量
劳委会私下表示，安全卫生检查是高度专业性问题，因为事业单位有管线、化学物质、机器设备等，如果非相关背景专业人士，无法执行任务。但过去安卫检查不受重视，相关专业人员不多，目前劳委会所属检查所劳动检查员都须领有检查证，才能执行劳动检查；如果未来五都各自执行，如何确保劳检质量，需要一段时间，「劳委会不是不放，而是不敢放」。
以云林六轻为例，六轻管线及设备复杂，原本就是高危险对象，劳委会中区检查所已投注不少人力，甚至派人驻守厂区，但是相对庞大的企业，检查人力不成比例，多数仰赖企业自主管理，劳委会为此还由检查处长多次进入厂区与六轻主管座谈，希望共同防范工安事件。